Действие игры "S.T.A.L.K.E.R.: Зов Припяти" разворачивается после окончания событий игры "S.T.A.L.K.E.R." и уничтожения Стрелком проекта "О-Сознание".

Узнав об открытии дороги к центру Зоны, правительство решает провести крупномасштабную военную операцию по взятию ЧАЭС под свой контроль. Операция получает кодовое название "Фарватер". Согласно плану этой операции, первая группа военных должна направиться для воздушной разведки территории, чтобы впоследствии составить детальные планы расположения аномальных полей. Затем по отмеченным безопасным проходам выдвинутся основные силы военных.

Несмотря на тщательную подготовку, операция терпит фиаско. Большинство вертолетов из ударной группы разбивается.
С целью сбора информации о причинах провала операции, Служба безопасности Украины направляет своего агента в центр Зоны.

Дальше все зависит от игрока.

Возможность продолжить игру после ее прохождения в режиме freeplay.

- Общая атмосфера игры более приближена к ТЧ
- Главный герой "ЗП" - бывший сталкер, которого завербовали военные спецслужбы
- Мы не встретим ни одного Выжигателя мозгов... следовательно и зомбированных сталкеров, но не факт
- От группировок остались лишь малые группы представителей
- Снижена общая численность населения Зоны
- Увеличено общее количество мутантов/монстров
- Переработан AI мутантов
- Добавятся новые виды живности
- Изменится система "прокачки" оружия
- Общее число артефактов уменьшится (в сравнении с ТЧ)
- Ассортимент артефактов не измениться (интересно, тут идёт речь о ТЧ или ЧН?)
- После выбросов буду рождаться артефакты
- Динамически передвигающиеся аномалии
- Специальные перевалочные лагеря для сна
- Режим игры "Freeplay" после прохождения основного сюжета
- Старых локаций не будет! (а зря!)
- Продолжительность игры будет больше чем в ЧН
- +- 70 уникальных квестов
- В плане графики и прочей оптимизации изменений очень мало
- Мультиплеер без изменений
- Меньшее кол-во багов :)

- Уменьшится количество аномалий на единицу площади
- Отсутствие "войны" группировок
- Отсутсвие транспорта!
- Поиск артефактов как в "ЧН"
- Не линейное выполнение квестов
- Пять локаций - три из них открыты сразу, две остальные - ссюжетные
- Фотореалистичный восточный район г.Припять для изучения
- Отсутствие случайных аномалий
- Появление и исчезновение артефактов после выбросов
- Новый интерфейс
- Два двуручных оружия в экипировке


- Под миникартой, для удобства добавятся часы.
- В инвентаре добавятся слоты для быстрого использования прдметов, так же их предназначения будут видны в основном режиме игры и кнопки выбора можно будет менять.
- В ПДА ГГ будет 5 разделов (список заданий, тайники, ключевые обьекты, побочные задания, важные персонажи) и открываться они будут на фоне "плана Зоны" (карты).
- В инвентаре добавится отдельная ячейка для шлема (противогаза).
- Теперь состояние оружия/брони будет показываться под их изображением в ячейках самого инвентаря.
- База Сталкеров на локации "Затон" (кладбище кораблей). В остове разрушенного корабля - бар, бармена зовут Борода.
- Игра не будет совместима с другими дополнениями.
- Сталкеры сами убивают мутантов, обходят аномалии, переодически ищут артефакт.
- Мутанты передвигаются быстрее, уворачиваются от пуль, стараются уйти из вида ГГ, бои с ними стали сложнее.
- Шлем ГГ намокает от дождя, соответственно экран монитора будет в воде.
- Трупы мутантов нельзя будет обыскивать, не будет частей тел мутантов.
- Уникальные аномалии, сделанные специально для сюжетных квестов.
- Еда уталяет голод.
- Между загрузками локаций, под загрузочным экраном будут отображаться различные советы, название которых "100 Советов по Выживанию в Зоне"
- На фоне основного меню игры показана река "Припять", вид даётся из разрушенного корабля; на гаризонте виднеется колесо обозрения и центральные район г. Припять, знакомые нам по игре "Тень Чернобыля".
- Различные препораты/аптечки действуют со временем.